Souches génétiques du VIH-1 et du VIH-2

Lun des principaux obstacles au traitement ou au développement dun vaccin efficace contre le VIH est la grande diversité génétique du virus lui-même. Alors que les virus qui utilisent de lADN double brin pour se répliquer sont relativement stables, les rétrovirus comme le VIH reculent dans leur cycle de réplication (en utilisant un ARN simple souche) et sont beaucoup moins stables. En conséquence, le VIH est très sujet aux mutations, en fait environ un million de fois plus fréquemment que les cellules utilisant lADN.

À mesure que la diversité génétique du virus sélargit et que différents sous-types viraux sont transmis dune personne à lautre, le matériel génétique mixte peut créer de nouveaux hybrides du VIH. Alors que la plupart de ces hybrides meurent, les quelques survivants présentent souvent une plus grande résistance au traitement anti-VIH et, dans certains cas, une progression plus rapide de la maladie.

La variabilité du VIH crée donc une sorte de « cible mobile » pour les chercheurs, avec de nouvelles souches recombinantes (génétiques combinées) capables de résister ou déviter complètement les agents neutralisants. Certaines, comme la souche A3/02 identifiée par des chercheurs suédois en 2013, sont capables dépuiser les défenses immunitaires dune personne de manière beaucoup plus agressive que les souches connues auparavant.

Que sont le VIH-1 et le VIH-2 ?

Il existe deux types de VIH : le VIH-1 et le VIH-2. Le VIH-1 est considéré comme le type prédominant, représentant la grande majorité des infections dans le monde, tandis que le VIH-2 est beaucoup moins courant et principalement concentré dans les régions dAfrique occidentale et centrale. Bien que ces deux types de VIH puissent conduire au SIDA, le VIH-2 est beaucoup plus difficile à transmettre et beaucoup moins virulent que le VIH-1.

Au sein de chacun de ces types de VIH se trouvent un certain nombre de groupes, de sous-types ("clades") et de sous-sous-types. Sans aucun doute, dautres sous-types et souches recombinantes seront découverts au fur et à mesure que la propagation mondiale du VIH se poursuivra.

Groupes et sous-types du VIH-1

Le VIH-1 est divisé en quatre groupes : Groupe M (signifiant « majeur »); Groupe O (ce qui signifie « la valeur aberrante » ou au-delà de lendroit où dautres groupes sont observés ); et Groupe N (signifiant "non-M" et "non-O"); et Groupe P (signifiant "en attente"). Les quatre groupes différents sont classés par les quatre différents virus de limmunodéficience simienne (VIS) connus pour être transmis des singes ou des chimpanzés à lhomme.

VIH-1 Groupe M

Le VIH-1 Groupe M a été le premier groupe à être identifié et représente aujourdhui environ 90% des cas de VIH dans le monde et peut être trouvé pratiquement dans toutes les parties de la planète. Au sein de ce groupe se trouvent 10 sous-types, qui peuvent être stratifiés selon, entre autres, leur répartition géographique et leur impact sur les différents groupes à risque.

• Sous-type A : observé en Afrique de lOuest et touchant principalement les hétérosexuels et les consommateurs de drogues injectables (UDI).

• Sous-type B : le sous-type prédominant en Europe, dans les Amériques, au Japon, en Thaïlande et en Australie, représentant presque toutes les infections en Amérique du Nord et environ 80 % de toutes les infections en Europe. Les infections surviennent plus chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) et les UDI que chez les hétérosexuels.

• Sous-type C : décrit comme le sous-type de VIH le plus répandu représentant 48 % de toutes les infections dans le monde, principalement hétérosexuelles et principalement en Afrique subsaharienne, en Inde et dans certaines parties de la Chine.

• Sous-type D : isolat principalement en Afrique orientale et centrale.

• Sous-type E : un sous-type observé uniquement sous une forme recombinante avec le sous-type A.

• Sous-type F : parmi un pourcentage plus faible dinfections observées en Afrique centrale, en Amérique du Sud et en Europe.

• Sous-type G : parmi un pourcentage plus faible dinfections observées dans certaines parties de lAfrique et de lEurope.

• Sous-type H : parmi un pourcentage plus faible dinfections observées en Afrique centrale.

• Sous-type J : observé en Afrique du Nord, centrale et occidentale, et dans les Caraïbes

• Sous-type K : limité à la République Démocratique du Congo (RDC) et au Cameroun.

VIH-1 Groupe O

Le VIH-1 du groupe O a été découvert en 1990 et ne représente que 1% des infections dans le monde. Ce groupe VIH est isolé au Cameroun et dans les pays africains voisins.

VIH-1 Groupe N

Le VIH-1 du groupe N a été découvert en 1998 et, encore une fois, na été observé quau Cameroun avec moins de 20 cas documentés à ce jour.

VIH-1 Groupe P

Le VIH-1 du groupe P est un type rare de VIH, identifié pour la première fois chez une femme camerounaise en 2009. Il peut être différencié des autres groupes VIH dans la mesure où ses origines ont été liées à une forme de VIS retrouvée chez les gorilles occidentaux. Bien que la classification « P » visait à déduire un statut « en attente » (cest-à-dire en attente de confirmation dune infection supplémentaire), un deuxième cas documenté a été identifié en 2011 chez un homme camerounais.

Groupes VIH-2

Bien que des cas de VIH-2 aient été identifiés ailleurs, les infections sont presque exclusivement observées en Afrique. Il existe actuellement huit groupes VIH-2, bien que seuls les sous-types A et B soient les seuls considérés comme épidémiques. On pense que le VIH-2 a croisé des espèces dun type de SIV affectant le singe mangabeys fuligineux directement à lhomme.

Le VIH-2 du groupe A est principalement observé en Afrique de lOuest, bien que les voyages internationaux aient conduit à une petite poignée de cas documentés aux États-Unis, en Europe, au Brésil et en Inde. En revanche, le VIH-2 du groupe B a été confiné à certaines parties de lAfrique de lOuest.